La distillation moléculaire est une distillation fractionnée sous vide poussé, dit moléculaire. Le temps de contact des molécules odorantes est très court ce qui évite leurs dégradations par la chaleur. Elle est largement utilisée par exemple pour décolorer des extraits. L'absolue de santal clair Nouvelle-Calédonie est un exemple de produit obtenu par cette technique.